Gene | Primer number | Position | Primer sequence (5' to 3') | AT (°C) | Cycle number | PCR (bp) | Sequence reference |
---|---|---|---|---|---|---|---|
DNA methylation of H19 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
ICRCTCF 1–2 | Primers 1 |  |  |  |  |  | AF049091 |
 |    Sens |  | GATTAGATAGTATTGAGTTTGTTTGGAGT |  |  |  |  |
 |    AntiSens |  | ATCAAAAACTAACATAAACCCCT | 47 | 35 |  |  |
 | Primers 2-Nested |  |  |  |  |  |  |
 |    Sens | 1377/ | GAGAAAATAGTTATTGTTTATAGTTTT |  |  |  |  |
 |    AntiSens | 1971 | CCTCATTAATCCCATAACTAT | 47 | 35 | 574 |  |
ICRCTCF 3–4 | Primers 1 |  |  |  |  |  | AF049091 |
 |    Sens |  | GGTTTTTTTGGTTATTGAATTTTAAAATTAG |  |  |  |  |
 |    AntiSens |  | AAAAACCATTCCCTAAATACACAAATACC | 47 | 35 |  |  |
 | Primers 2-Nested |  |  |  |  |  |  |
 |    Sens | 2825/ | TTAGTGTGGTTTATTATAGGAAGGTATAGAAGT |  |  |  |  |
 |    AntiSens | 3433 | TAAACCTAAAATACTCAAAACTTTATCACAAC | 47 | 35 | 660 |  |
Proximal promoter | Primers 1 | Â | Â | Â | Â | Â | AF049091 |
 |    Sens |  | TGATTGGTTAGTTTTTGAGTTTT |  |  |  |  |
 |    AntiSens |  | TAATAACTAATTTAAACACTCCTCACC | 50 | 40 |  |  |
 | Primers 2 |  |  |  |  |  |  |
 |    Sens | 4648/ | GGTGTTTTGATTTGTGG |  |  |  |  |
 |    AntiSens | 5019 | TAATAACTAATTTAAACACTCCTCACC | 50 | 40 | 371 |  |
Expression analysis | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
H19 | Primers | Â | Â | Â | Â | Â | NR_001592.1 |
 |    Sens | 6995/ | ACATGACATGGTCCGGTGT |  |  |  |  |
 |    AntiSens | 7145 | TCCCATGGTGTTAACGAAGGC |  |  |  |  |
 | Universal Probe 55 |  | GGAGAGGA | 54 | 55 | 69 |  |
SDHA | Primers | Â | Â | Â | Â | Â | NM_023281.1 |
 |    Sens | 1435/ | CCCTGAGCATTGCAGAATC |  |  |  |  |
 |    AntiSens | 1504 | TCTTCTCCAGCATTTGCCTTA |  |  |  |  |
 | Universal Probe 80 |  | CCTGGAGA | 54 | 55 | 70 |  |